Shinoda ialah generasi ketiga Jepun Amerika.[74][75] Bapa dan ibu saudaranya terpaksa hidup dalam Kem Internmen Jepun-Amerika semasa Perang Dunia II.[76][77][78] Beliau berkahwin dengan penulis Anna Shinoda (née Hillinger) pada tahun 2003[79] dan mempunyai dua orang anak.[80] Shinoda telah dianugerahkan dengan Anugerah Kecemerlangan Muzium Negara Jepun Amerika pada tahun 2006.[59] Pada tahun 2009, beliau menerima Ijazah Doktor Kehormat Humane Letters (L.H.D.) dari Kolej Pusat Seni Rekabentuk. East West Players memberi penghormatan kepada Shinoda dengan Anugerah Berwawasan dan makan malam pada tahun 2010.[59] Beliau juga telah menyatakan minat dalam politik. Shinoda mula menulis artikel untuk The Big Issue pada September 2012 dan merupakan wartawan pilihanraya penerbitan AS.[81]